Het Belgisch kampioenschap tijdrijden voor heren elite2016 werd gehouden op 23 juni 2016 in en rond Mol. De winnaar van de wedstrijd mag een jaar tijdritten afwerken in de Belgische trui. De winnaar van vorig jaar was Jurgen Van den Broeck, maar die verdedigde in 2016 zijn titel niet. Aan de wedstrijd mochten enkel Eliterenners met een profcontract deelnemen. Victor Campenaerts behaalde de titel, in een tijd van 46:18. Yves Lampaert werd voor de tweede maal op rij tweede op drie seconden. Ben Hermans haalde de derde plaats met 12 seconden achterstand op de winnaar.