De Copa Mercosur 2000 was de derde editie van deze voetbalcompetitie. Het toernooi stond enkel open voor ploegen uit ploegen uit de vijf zuidelijke landen van Zuid-Amerika: Argentinië, Brazilië, Chili, Paraguay en Uruguay. Ploegen uit het noorden van het continent speelden in de tegenhanger van dit toernooi, de Copa Merconorte. Net als de eerste twee edities ging de finale in 2000 ook tussen twee ploegen uit Brazilië: CR Vasco da Gama won hun eerste titel door SE Palmeiras te verslaan. Voor Palmeiras was het de derde keer dat ze in de eindstrijd stonden. Titelverdediger CR Flamengo werd in de kwartfinales uitgeschakeld door CA River Plate.
Aan het toernooi deden twintig ploegen mee, waarvan twee debutanten: het Braziliaanse Clube Atlético Mineiro, de nummer twee van de Braziliaanse competitie, verving Grêmio FBPA (kampioen SC Corinthians Paulista was al zeker van deelname). CA Rosario Central uit Argentinië kwam in de plaats van Racing Club. Rosario Central was in de Argentijnse competitie vierde geëindigd in de totaalstand[2] en was daarmee de beste ploeg die niet zeker was van automatische deelname.[3] Voor Chili, Paraguay en Uruguay deden dezelfde ploegen mee als bij de vorige edities.
De twintig deelnemende clubs werden verdeeld in vijf groepen van vier teams. In de groepsfase speelde elk team twee keer (thuis en uit) tegen de drie tegenstanders. De groepswinnaars plaatsten zich voor de knock-outfase, samen met drie beste nummers twee. De kwartfinales en de halve finales bestonden uit een thuis- en een uitduel. Het team dat de meeste doelpunten maakte plaatste zich voor de volgende ronde. Bij een gelijke stand werden er strafschoppen genomen. De finale werd in een soort best-of-three gespeeld: indien beide ploegen één duel wonnen (of beide duels eindigden gelijk), dan werd er een beslissingswedstrijd gespeeld.
De groepsfase vond plaats tussen 1 augustus en 25 oktober. De groepswinnaars plaatsten zich voor de kwartfinales, samen met de drie beste nummers twee.[4]
↑In de Argentijnse competitie werden twee kampioenschappen uitgereikt (de Apertura en de Clausura). Het totaalklassement van beide competities besliste over deelname aan internationale toernooien.
↑CA River Plate (eerste), CA Boca Juniors (tweede), CA San Lorenzo de Almagro (derde) en CA Independiente (zesde) waren automatisch verzekerd van deelname aan de Copa Mercosur 2000. Het laatste Argentijnse ticket ging naar CA Vélez Sarsfield (vijfde), dat ook in 1998 en 1999 al deelnam aan de Copa Mercosur.
↑ abcAndere bronnen geven het aantal toeschouwers voor de finaleduels als 25.000 (eerste wedstrijd), 18.396 (tweede wedstrijd) en 29.993 (beslissingswedstrijd).
CR Vasco da Gama (1e titel)
Argentinië (AFA)
Chili (FFCh).svg){kind=small}
Paraguay (APF)
Uruguay (AUF)
45'
· 
· 