Ngongo werd geboren in Brussel.[1] Op zijn tweede verhuisde hij naar Asse.[1] Ngongo begon zijn jeugdopleiding bij Asse-Zellik 2002.[1] Hij werd er opgepikt door RSC Anderlecht, waar hij enkel bij de provinciale jeugd speelde.[1] Uiteindelijk zette hij zijn jeugdopleiding verder bij FCV Dender EH, waar hij in 2018 zijn officiële debuut maakte in het eerste elftal.[1] In 2022 promoveerde hij met de club naar Eerste klasse B.