Het slalom kanovaren in de C-1-klasse op de Olympische Zomerspelen 2016 vond plaats van zondag 7 tot en met dinsdag 9 augustus 2016. Regerend olympisch kampioen was Tony Estanguet uit Frankrijk, die niet tot de Franse equipe behoorde en zijn titel niet verdedigde; een landgenoot volgde hem desalniettemin op. In de series, die plaatsvonden op 7 augustus, legde elke deelnemer tweemaal het parcours af. De veertien beste kanovaarders plaatsten zich voor de halve finale. In de halve finale legde iedereen het parcours eenmaal af, waarbij de vier deelnemers met de langzaamste tijden afvielen. In de finaleronde won de kanoër met de snelste tijd, waarbij het aantal strafseconden werd opgeteld.