Sebastiaan Pot speelde in de jeugd van Feyenoord, SC Feyenoord, VV Nieuwerkerk en Sparta Rotterdam. Hij debuteerde voor Sparta in de Eerste divisie op 16 april 2004, in de met 0-0 gelijkgespeelde thuiswedstrijd tegen TOP Oss. Het seizoen erna, waarin Sparta naar de Eredivisie promoveerde, kwam hij niet in actie en in het seizoen 2005/06 werd hij teruggezet naar Jong Sparta. De tweede seizoenshelft werd Pot verhuurd aan Stormvogels Telstar, waar hij twee wedstrijden speelde.[3] Nadat zijn contract bij Sparta in 2006 afliep, vertrok hij naar DOTO. Hierna speelde hij nog voor vv Capelle, SV JHR, RKSV Leonidas, XerxesDZB en ASWH.